故事舞臺(tái)位于21世紀(jì)中期的東京，因氣候暖化導(dǎo)致城市被熱帶密林吞噬，人類(lèi)在希臘巨神阿特拉斯命名的空中高塔建立新家園。貧困者被迫留在地面，在密林與極端環(huán)境中共存，少女北條國(guó)子剛從少年教養(yǎng)院釋放，便被迫面對(duì)生存危機(jī)。為探尋傳說(shuō)中的理想鄉(xiāng)"香格里拉"，她與個(gè)性迥異的同伴組成反抗組織"化外者"，在充斥熱帶病毒、變異生物與政府監(jiān)控的殘酷環(huán)境中展開(kāi)以生命為賭注的戰(zhàn)斗。眾人逐漸發(fā)現(xiàn)"阿特拉斯"系統(tǒng)通過(guò)腦內(nèi)植入裝置操控民眾的真相，最終揭露整個(gè)空中都市實(shí)為虛擬現(xiàn)實(shí)實(shí)驗(yàn)場(chǎng)的驚悚事實(shí)。在生存與自由意志的抉擇中，他們必須突破政府設(shè)置的認(rèn)知牢籠，重啟真實(shí)世界的人類(lèi)文明。