在晴朗明媚的日子里，自稱廢柴的學生逆回十六夜（淺沼晉太郎配音）、溫柔善良的春日部耀（中島愛配音）以及高傲自大的久遠飛鳥（布里德卡特·塞拉·惠美配音）各自收到神秘邀請函，信中寫道：“告知煩惱眾多、擁有異能的少男少女，若期望一試才能，就拋棄世上一切到‘箱庭’來”。三人作為擁有超能力的問題兒童被召喚至風景秀美的異世界，遇見說明人黑兔（野水伊織配音）。他們被告知需運用天賜異能參與神魔游戲。十六夜等人與前魔王金絲雀（小西克幸配音）締結契約，加入名為“No Name”的弱勢共同體，在箱庭展開爭奪生存權與尊嚴的戰斗。隨著階層主連戰、恩賜游戲對決等危機接連展開，三人逐漸揭開箱庭世界隱藏的真相——飛鳥母親遺留的秘密、十六夜被抹去的記憶，以及維系世界根基的“大游戲”陰謀。最終他們以不按常理出牌的方式逆轉劣勢，證明自身價值并獲得留居箱庭的資格。