陳華（巫啟賢飾）與高飛（陳豪飾）、貓仔、喪牛等一班朋友因學業后進，轉而步入幫派生活。陳華和高飛等人通過暴力手段將對手趕出地盤，稱霸慈云山并組成“慈云山十三太保”。然而，在父親（鄭則仕飾）的嚴厲管教和惡警“魔鬼蕭”（何家駒飾）的持續壓迫下，陳華被精神頹靡的高飛引入毒品漩渦。吸毒期間，他在惡警暴力執法中遭受嚴重身心創傷。為兌現女友（陳國邦飾）的期望，陳華多次嘗試戒毒失敗后，在高飛因吸毒過量死亡的刺激下徹底醒悟。最終，他在父親以生命為代價的感召和女友不離不棄的支持下成功戒毒，并加入社會組織開始從事青少年反毒品教育工作。本片根據陳慎之、電影人李兆基等人的真實經歷改編，呈現了慈云山十三太保從墮落深淵到自我救贖的完整軌跡。