杰森·伯恩（馬特·達蒙飾）在意大利被人從海上救起，他失去了記憶，除了臀部的瑞士銀行帳號之外，完全無法證明自己的身份。杰森從瑞士銀行取出大量現金、六本護照和一把槍，發現自己具備格斗、槍械和語言等特殊技能，開始追查身份真相，并將陌生女子瑪麗（弗蘭卡·波滕特飾）卷入事件。兩人從瑞士逃亡至巴黎，途中遭到CIA特工組成的神秘殺手組織追殺。隨著調查深入，杰森逐步發現"絆腳石計劃"的真相——自己是經過基因改造與特訓的失敗實驗體。最終他通過巴黎公寓內的加密文件揭露CIA陰謀，在與追殺者正面對峙后選擇放棄復仇，帶著瑪麗駕車駛向邊境。整個過程中，伯恩始終在尋找身份認同與人性救贖之間掙扎，最終以自我放逐的方式完成對組織背叛的終極反抗。