第三季故事開始于第二獨立團抵達查爾斯頓七個月后，查爾斯頓被確立為「新美利堅合眾國」首都。TomMason作為政治領(lǐng)袖（相當(dāng)于總統(tǒng)）更多參與前線軍事指揮而非政務(wù)，其對外星侵略者采取比前任Manchester博士更具侵略性的主動策略。人類政府與起義外星種族「突擊者」形成脆弱同盟，Tom允許后者留在查爾斯頓共同對抗Espheni外星族（即「魚頭」），但引發(fā)部分人類質(zhì)疑，雙方矛盾持續(xù)發(fā)酵。突擊者戰(zhàn)士在戰(zhàn)斗時以紅黃條紋涂滿面部，以此紀(jì)念第二季結(jié)尾犧牲的領(lǐng)袖「紅眼」。Tom之子Ben擔(dān)任人類與突擊者間的聯(lián)絡(luò)官，其身份背景引發(fā)雙方陣營信任危機。盡管組成臨時聯(lián)盟，人類與突擊者仍面臨實力懸殊的困境：Espheni族新繼位君王比前任更具威脅性，且地球戰(zhàn)場在雙方激戰(zhàn)時迎來第三個外星種族的介入，局勢進一步復(fù)雜化。