故事舞臺(tái)設(shè)定在13年前東京秋葉原發(fā)生的六名少女離奇失蹤懸案"秋葉原神隱"。曾被譽(yù)為天才創(chuàng)作者的新城大輝為游戲展籌備以該事件為藍(lán)本的互動(dòng)式推理游戲《AKIBALOST》，卻在發(fā)布會(huì)后接到神秘電話威脅要求終止開(kāi)發(fā)，否則將重現(xiàn)悲劇。擔(dān)任游戲測(cè)試員的大輝妹妹葵突然失蹤后，大輝被迫在完成作品與營(yíng)救親人之間抉擇。隨著調(diào)查深入，發(fā)現(xiàn)當(dāng)年失蹤者遺留的神秘符號(hào)竟與秋葉原地下游戲廳"幻影基地"有關(guān)，而此次綁架案的作案手法與13年前高度相似。警方確認(rèn)新舊案件存在同一性，游戲測(cè)試團(tuán)隊(duì)成員陸續(xù)遭遇針對(duì)性威脅，最終通過(guò)復(fù)原失蹤者最后接觸的虛擬空間系統(tǒng)，揭開(kāi)了跨越時(shí)空的連環(huán)誘拐真相。