故事舞臺設定在13年前東京秋葉原發(fā)生的六名少女離奇失蹤懸案"秋葉原神隱"。曾被譽為天才創(chuàng)作者的新城大輝為游戲展籌備以該事件為藍本的互動式推理游戲《AKIBALOST》，卻在發(fā)布會后接到神秘電話威脅要求終止開發(fā)，否則將重現(xiàn)悲劇。擔任游戲測試員的大輝妹妹葵突然失蹤后，大輝被迫在完成作品與營救親人之間抉擇。隨著調查深入，發(fā)現(xiàn)當年失蹤者遺留的神秘符號竟與秋葉原地下游戲廳"幻影基地"有關，而此次綁架案的作案手法與13年前高度相似。警方確認新舊案件存在同一性，游戲測試團隊成員陸續(xù)遭遇針對性威脅，最終通過復原失蹤者最后接觸的虛擬空間系統(tǒng)，揭開了跨越時空的連環(huán)誘拐真相。