許多年前，亞特蘭蒂斯女王（妮可·基德曼飾）與人類(lèi)相知相戀，誕下混血之子亞瑟·庫(kù)瑞（杰森·莫瑪飾）。在海底導(dǎo)師維科（威廉·達(dá)福飾）的嚴(yán)苛訓(xùn)練下，亞瑟逐漸掌握操控海洋生物的能力，卻始終因私生子身份無(wú)法見(jiàn)容于海底世界。其同母異父兄弟奧姆（帕特里克·威爾森飾）繼任亞特蘭蒂斯國(guó)王后，以人類(lèi)污染海洋為由聯(lián)合海底七國(guó)發(fā)動(dòng)戰(zhàn)爭(zhēng)。為阻止這場(chǎng)浩劫，維科與奧姆的未婚妻湄拉（安珀·赫德飾）帶領(lǐng)亞瑟穿越重重險(xiǎn)境，踏上尋找傳說(shuō)中能統(tǒng)御七國(guó)的三叉戟之旅。在海底深淵與遠(yuǎn)古文明遺跡間，亞瑟直面魚(yú)人軍團(tuán)、海溝族怪物等強(qiáng)敵。最終他奪得三叉戟，以半神之力擊敗奧姆并廢黜其王位，在七國(guó)加冕儀式上宣布建立包容陸地與海洋的新秩序，終結(jié)持續(xù)萬(wàn)年的仇恨紛爭(zhēng)。