北高加索地區，恐怖分子頭領巴茲加耶夫命令其武裝力量籌集資金以購買可替代的對空攻擊系統，同時在格魯吉亞發現一批老式導彈并指派心腹伊沙負責跨境運輸。莫斯科反恐指揮部拉維爾將軍聯合葉戈爾少校組建特別行動組，通過追蹤資金流向鎖定目標。在押解審訊巴茲加耶夫保鏢過程中，行動組獲取關鍵情報確認其藏匿位置，代號"清算計劃"的特別行動隨即展開。特種部隊穿越高加索山脈實施多點滲透，在格魯吉亞邊境與恐怖分子爆發激烈交火，成功攔截導彈運輸車隊并摧毀武器庫。最終行動組突襲巴茲加耶夫地下堡壘，經過近身搏殺擊斃這名制造多起恐怖襲擊的元兇。