清廷視少林寺為心腹大患,利用安插的內奸火燒寺院,調遣高手展開血腥圍剿。少林僧眾與俗家弟子倉促迎戰,傷亡慘重,僅少數幸存者突圍而出。方大洪(孟飛)南逃廣東與李式開(戚冠軍)匯合,共謀反清復明大計;胡德帝(姜大衛)、蔡德忠(狄龍)、馬超興(傅聲)則北上中原,誓要揪出導致滅寺的內奸并復仇雪恨。五人在歷經生死考驗后,曾對少林武學產生動搖,最終領悟亡寺之劫實因自身武功未臻化境,遂閉關苦修突破武學瓶頸。待重出江湖時,五人以超凡身手殲滅清廷勢力,其事跡被后世尊為“少林五祖”,開創洪門武林新格局。