《候鳥e人》以臺灣多地濕地為背景，講述一群熱愛生態的年輕人在保護候鳥遷徙過程中交織出的愛恨糾葛。邵韓、小青與湘子因共同志愿結識，卻陷入復雜的情感三角關系。邵韓與小青在七股賞鳥途中意外相識，從針鋒相對到漸生情愫，期間既要面對小汪對小青的單戀，又因邵韓的初戀對象湘子意外歸來而陷入兩難。原來被誤認為死亡的湘子帶著未解心結重返眾人生活，不僅令邵韓深陷新歡舊愛的抉擇困境，更牽扯出當年導致兩人分離的致命誤會。與此同時，丁丁默默守護著小汪，而一直暗戀丁丁的小謝則以真誠陪伴化解情感困局。故事跟隨候鳥遷徙軌跡，從臺南濕地輾轉至臺北都市，在自然守護與人性救贖中見證各角色的成長蛻變，最終邵韓選擇直面內心情感接納小青，湘子解開心結遠走他鄉，丁丁與小謝修成正果。