閻王寶藏一案后，梅雨墨登基稱帝，白雪晴則因未解隱情離開京城。數年后陽城瘟疫蔓延至皇城，梅雨墨攜侍衛佟安微服出巡，在查訪途中遭黑店圍困，幸得精通醫術的日本女子晴明相救。此時白雪晴與捕快秦三川結伴返京，二人通過疫病藥材流向線索逐步揭開真相。命運使然下，已成陌路的梅雨墨與白雪晴因瘟疫調查再度交匯。紫禁城內，六貝勒聯合仁貴妃暗中操控藥材調度，借疫病危機勾結海外勢力實施篡位計劃。隨著列強通過瘟疫擴散施壓清廷，梅雨墨與白雪晴摒棄前嫌，在晴明協助下追查到境外投毒證據，最終將內外勾結的亂黨一網打盡，卻在收網時發現瘟疫源頭竟與閻王寶藏存有隱秘關聯。