《重任在肩第五季》圍繞一宗重大毒品劫案展開：一批押運中的毒品被蒙面武裝團伙劫奪，三名隨行警員遇害。現場證據指向警方內部存在泄密者，反腐敗專案組AC-12由此介入調查。案件核心嫌疑人鎖定為犯罪集團頭目John Corbett，其真實身份卻遠比表面復雜——他是英國軍情五局（MI5）秘密派駐內政部的特工，與政府高層存在隱秘關聯。隨著調查深入，AC-12發現此案牽涉跨部門權力網絡，涉及反恐機構與犯罪組織的非法交易。專案組通過臥底滲透、監控取證等手段逐步揭開腐敗鏈條，最終與武裝團伙展開激烈對峙。行動中暴露出的情報機構黑幕及系統性瀆職行為，再次將AC-12推向揭露體制陰暗面的風口浪尖。