少年路飛與伙伴們在航行中遭遇墜落的巨型船只，意外獲得指向天空之島的地圖。他們結識了自稱探險家后裔的克里特，通過其祖先諾蘭遺留的航海日志發現空島真實存在的證據。穿越致命海流后，眾人抵達云層之上的神之國斯基亞，卻得知此地被自封為"全能神"的艾爾統治。在空之騎士福爾與居民科尼斯的幫助下，草帽一伙揭露了艾爾偽神身份并將其擊敗。特別篇延續原作空島篇章核心設定，新增原創劇情展現重制版的兩小時冒險。作為天空統治者的艾尼路攜雷神之力歸來，與路飛等人展開激烈對決。本片以富士電視臺特別企劃形式呈現，在保留空島文明、歷史正文與黃金鐘等關鍵元素的基礎上，通過全新敘事手法再現經典篇章。