位于南洋腹地的一個無名小島隱藏著科技發(fā)達(dá)的實(shí)驗(yàn)室，科學(xué)家在此通過提取遠(yuǎn)古遺跡中的夢幻基因并實(shí)施基因改造工程，人工培育出最強(qiáng)寶可夢超夢。超夢誕生后因身份認(rèn)知困惑而暴走，被神秘男子以操控世界的承諾蠱惑聯(lián)手對抗各地訓(xùn)練家。盡管接連擊敗眾多對手，超夢始終無法解答"我是誰"的核心疑問，內(nèi)心矛盾激化至頂點(diǎn)后再度脫離控制，帶著對人類的憎恨重返誕生地。當(dāng)科學(xué)家舊部率眾追至小島時，超夢與入侵者展開激烈對戰(zhàn)。最終夢幻現(xiàn)身引導(dǎo)同類相遇，在雙重鏡像映照下超夢領(lǐng)悟到生命本質(zhì)并非源于被創(chuàng)造的形態(tài)，而是存在于自我意識的確立過程。伴隨著實(shí)驗(yàn)室崩塌與追擊者的撤離，超夢在晨曦中凝視新生的夢幻基因體，最終選擇孤獨(dú)地踏上尋求存在意義的永恒之旅。