《十二猴子第三季》以三天密集播出十集的方式呈現(xiàn),首日四集后續(xù)各三集。作為最終季的前序,故事延續(xù)時(shí)空穿梭主線(xiàn):科爾為阻止末日病毒“泰坦”穿越至2163年尋找關(guān)鍵線(xiàn)索,而被俘的雷利被迫在道德困境中抉擇。時(shí)間旅行團(tuán)隊(duì)“守護(hù)者”現(xiàn)身一戰(zhàn)后法國(guó)阻撓科爾與瓊斯尋找珍妮弗·戈恩斯,雷姆斯押送宿敵回基地引發(fā)信任危機(jī)。雙線(xiàn)任務(wù)延伸至2007年刺殺“見(jiàn)證者”的陷阱行動(dòng)、1989年宗教文件盜竊案,以及1953年十二猴子軍團(tuán)誕生之謎。科克·勞埃德客串反派先驅(qū)。隨著時(shí)空穿梭密度升級(jí),科爾與雷利在維多利亞時(shí)代倫敦追捕見(jiàn)證者,最終揭露其真實(shí)身份。各條線(xiàn)索匯聚于終章,泰坦威脅逼近臨界點(diǎn),盟友被迫對(duì)抗,“見(jiàn)證者”命運(yùn)抉擇與人類(lèi)存亡緊密交織。