某小村中學(xué)里對(duì)考古具有濃厚興趣的老師八部高史（竹中直人飾）與其學(xué)生月島令子（上野めぐみ飾）在研究過程中突然失蹤，引發(fā)校園恐慌與流言四起。行為古怪的考古學(xué)家稗田禮二郎（沢田研二飾）受八部邀請(qǐng)來到學(xué)校，在救助其子正雄（工藤正貴飾）時(shí)，意外發(fā)現(xiàn)八部考察古墓期間釋放了被封印的妖怪比留子。稗田通過自主研發(fā)的妖怪探測(cè)器，在夜晚與正雄潛入學(xué)校展開調(diào)查，證實(shí)比留子系《古事記》記載的初神伊耶那岐與伊耶那美之子，其復(fù)活后開始以古墓為中心向校園蔓延血腥災(zāi)厄。正雄既擔(dān)憂父親安危又牽掛暗戀對(duì)象令子，隨稗田深入追查的過程中逐漸接近真相。影片根據(jù)諸星大二郎漫畫《妖怪ハンター》改編，以民俗傳說與現(xiàn)代校園為背景交織展開神秘事件。