《遺跡守護者》改編自岡田伸一原作漫畫，講述民間組織"阿卡姆"致力于保護超古代文明遺跡的故事。該組織精英部隊SPRIGGAN中實力位列榜首的17歲少年御神苗優(yōu)（森久保祥太郎配音），在土耳其執(zhí)行調(diào)查任務時意外發(fā)現(xiàn)傳說中的諾亞方舟。這艘承載滅世之力的遠古遺物引發(fā)多方勢力爭奪，美國派出由半機械改造人組成的特殊部隊與"阿卡姆"展開激烈交鋒。其中名為雷歐·巴爾德的改造人少年妄圖獨占方舟能量，企圖重啟第二次大洪水重塑世界。面對失控的滅世危機，御神苗優(yōu)在隊友掩護下突破重圍，最終以SPRIGGAN特制武器摧毀方舟核心裝置。這場關乎人類存亡的遺跡爭奪戰(zhàn)，隨著雷歐駕駛的巨型機械神像被擊破而落下帷幕。片尾暗示"阿卡姆"將繼續(xù)守護世界遺跡安全，抵御潛藏的文明威脅。