波吉亞家族第二季于2012年春季回歸，教皇亞歷山大六世的統治表面穩固實則危機四伏。外部新舊敵人暗中聯合，內部家族成員的權力角逐持續升級：Cesare（弗朗索瓦·阿爾諾飾）與Juan（大衛·奧克斯飾）兄弟徹底決裂，前者借軍事行動擴張勢力尋求獨立話語權；Lucrezia（霍利·格林格飾）在政治婚姻與情感自主間反復撕裂，其極端選擇映射出家族利益對個體的吞噬。教皇通過與法國國王查理八世結盟暫時穩固地位，但尤利烏斯二世（科魯姆·費奧瑞飾）作為潛在對手已顯露崢嶸野心，其未來對教廷權力的沖擊成為貫穿全季的暗線。家族成員在宗教權威、血腥政治與人性掙扎中推進著各自命運，波吉亞王朝的輝煌與腐朽在權謀漩渦中愈發分明。