江戶川柯南因阿笠博士家浴室故障，隨小蘭、灰原哀前往大眾浴池時(shí)滑倒撞頭并被兩名神秘人帶走。天才詐欺師娜娜與殺手近藤將失憶的柯南藏匿于隱蔽別墅，偽裝成其父母。阿笠博士與灰原哀追蹤途中遭遇嚴(yán)重車禍?zhǔn)芾В饶人鶎俚姆缸锝M織計(jì)劃實(shí)施炸彈恐怖襲擊。與此同時(shí)，《周刊少年Sunday》編輯水島早苗因懷疑丈夫近藤有外遇，委托毛利小五郎展開調(diào)查。隨著調(diào)查深入，以柯南為核心誘餌的連環(huán)陰謀逐漸顯露：犯罪團(tuán)伙試圖通過制造爆炸案為被逮捕的首領(lǐng)復(fù)仇。最終柯南在眾人協(xié)助下恢復(fù)記憶，與毛利小五郎及警視廳聯(lián)手破解炸彈危機(jī)，近藤與娜娜的犯罪計(jì)劃徹底敗露并被警方逮捕。