故事發(fā)生在五百年前的大明朝京師,天和醫(yī)館館主陳幕禪(楊皓宇飾)以專治疑難雜癥聞名,卻暗中擔任西廠特務(wù)。某日陳幕禪突然失蹤,立志成為御醫(yī)的學(xué)徒朱一品(陳赫飾)意外獲得其遺留的重要卷軸,引發(fā)連鎖反應(yīng)。醫(yī)館大小姐陳安安(張子萱飾)因父親失蹤悲痛欲絕,朱一品與師兄弟趙布祝(佟磊飾)被卷入風波。為查清真相,東廠高手楊宇軒(王傳君飾)與西廠特工柳若馨(姜妍飾)相繼潛入醫(yī)館,雙方在明爭暗斗中逐步揭露卷軸背后的朝廷秘辛。隨著調(diào)查深入,眾人發(fā)現(xiàn)陳幕禪失蹤與一樁牽動朝局的陰謀有關(guān),而醫(yī)館內(nèi)部在破解疑案的過程中也衍生出錯綜復(fù)雜的感情糾葛。各懷心思的醫(yī)館眾人最終合力化解危機,既揭開謎團又修復(fù)了彼此關(guān)系。