電影《奇門相術》由三個獨立故事組成。唐朝時期，鰩縣百姓濫殺生靈導致惡物盤踞食人幼子，神秘客“十三”途經此地斬妖除魔，令當地重歸安寧；明朝年間，富家少爺糟蹋糧田激起民怨，“十三”再度現身以奇術懲戒惡人平息天怒；民國時代，富豪楊家因重男輕女引發家庭矛盾，幼女以“見鬼”謊言制造恐慌，“十三”洞察真相后巧妙化解親情危機。三個時空中的“十三”均以旁觀者身份介入，通過破解命理玄機消弭災禍，最終串聯起跨越千年的民間因果輪回。