經歷了動蕩的明治維新，日本迎來新的時代。在明治政府第十個年頭，不祥的氣息彌漫東京。惡德實業家武田觀柳（香川照之飾）操縱女醫師高荷惠（蒼井優飾）研制新型鴉片，以毒害民眾謀取暴利，并通過綁架其妹妹迫使高荷惠就范。武田公開招攬落魄武夫，大肆收購周邊土地，有條不紊地實現他的狼子野心。在此期間，以劊子手拔刀齋之名濫殺無辜的鵜堂刃衛（吉川晃司飾）引起了前新選組頭目齋藤一（江口洋介飾）的注意，也迫令隱姓埋名多年的拔刀齋本尊緋村劍心（佐藤健飾）登場。寄居在神谷道場的緋村漸漸融入神谷薫（武井咲飾）和周邊庶民的平和生活之中。然而武田欲壑難平，為了保護善良的人，劍心不得不拔出逆刃刀和相樂佐之助（青木崇高飾）勇闖虎穴，與武田豢養的殺手集團展開激戰，并最終挫敗其陰謀。本片根據漫畫家和月伸宏的經典原作改編。