又是一年新年，灰太狼（張琳配音）與紅太狼（趙娜配音）喜得兒子小灰灰（梁穎配音），為讓從未嘗過羊味的小灰灰開葷，灰太狼再度前往羊村。此時青青草原正舉辦羊村百年慶典，但村長慢羊羊（高全勝配音）的坐騎蝸牛突發異變，經驗豐富的村長察覺百年前瘟疫即將重臨。為拯救羊村并查明病因，喜羊羊（祖麗晴配音）等人服下縮小藥水進入蝸牛體內探查，灰太狼緊隨其后潛入。在蝸牛內部，雙方分別遭遇白牛軍與黑牛軍團的襲擊，兩大病毒勢力以分裂對抗為生存法則。經歷系列冒險后，羊狼兩族被迫聯手對抗共同敵人，最終通過協作消滅病毒軍團。瘟疫消除后青青草原重獲健康環境，灰太狼一家與羊族在特殊境遇中達成短暫和解。本片為動畫《喜羊羊與灰太狼》首部電影版，獲2009年美猴獎最佳動畫配音獎、中國電影華表獎最佳動畫片獎及金龍獎最佳動畫長片獎等多項榮譽。