蟹堡王二號店即將開業，海綿寶寶滿心期待卻意外發現經理職位被章魚哥取代。與此同時，痞老板盜取海王星國王的三叉戟王冠并嫁禍蟹老板。憤怒的海王星判處蟹老板死刑，但為取回王冠給予海綿寶寶和派大星六天期限前往危險的貝殼城完成任務。趁機竊取蟹黃堡配方的痞老板借新配方迅速擴張，更通過可操控思想的機械頭盔向顧客實施精神控制以圖統治海洋世界。海綿寶寶與派大星踏上充滿荒誕笑料的冒險旅途，穿越暗藏獨眼巨人的貝殼城廢墟展開尋冠行動。最終兩人成功奪回王冠，揭穿痞老板陰謀并解救蟹老板，在恢復蟹黃堡和平的同時挫敗了這場企圖操控海洋生物的邪惡計劃。