《大敦煌》以北宋、清末、民國三個歷史時期為背景，通過金字大藏經的傳承脈絡展現千年敦煌的文化史詩。上部講述北宋仁宗年間，西夏王李元昊借道敦煌遭拒后發兵威脅，歸義軍首領曹順德之妻珍娘為保全百姓自焚明志，畫師方天佑與于闐公主梅朵合力封存藏經洞，最終敦煌陷落時珍娘赴火、梅朵跳崖的悲壯結局。中部聚焦清末工部主事秦文玉追查兄長死因，揭露英國探險家貝克借地震盜寶的陰謀，卻在八國聯軍入侵背景下目睹文物遭劫外流，秦文玉與護寶義士紅蓮、大剛等倒在官軍槍口下的悲劇。下部描繪1936年旅法畫家梁墨琰夫婦為保護敦煌壁畫與盜寶者及日本特務千葉三郎展開斗爭，梁墨琰犧牲后其妻蘇清平繼承遺志，在民眾支持下完成文化守護，千葉三郎亦在沖突中實現良知覺醒。全劇以敦煌"藏寶、奪寶、護寶"三部曲結構，串聯起跨越千年的文化守護精神。