《血色星期一》第二部延續(xù)緊張氛圍，天才黑客高木藤丸（三浦春馬飾）因兩年前成功阻止病毒危機而隱退，但受后遺癥影響徹底遠離網(wǎng)絡(luò)。兩年后，東京再次陷入危機——一架裝載核彈的無人飛機正悄然逼近城市，平民對此毫無察覺。藤丸被迫與好友九條音彌（佐藤健飾）、高木遙（川島海荷飾）重出江湖，他們發(fā)現(xiàn)幕后黑手除恐怖分子折原瑪雅（吉瀨美智子飾）外，還牽扯到神秘組織成員神崎潤（成宮寬貴飾）。在與新人反派勢力周旋過程中，團隊通過破解加密通訊、追蹤資金流向逐步鎖定核彈位置。最終通過與國際反恐機構(gòu)合作，成功在千葉縣近海擊落攜帶核彈的無人機，挫敗了企圖引發(fā)第三次核污染事件的陰謀。事后揭露神崎潤實為被利用的棄子，真正主謀指向與前作病毒事件關(guān)聯(lián)的跨國情報組織。