《巴比倫柏林第二季》延續1920年代末魏瑪共和國背景，Charlotte Ritter通過司法考試后正式加入柏林刑事警察廳政治部，在蘇聯外交官謝爾蓋·卡爾達科夫隨員身份的死者案件中與探長Gereon Rath形成工作搭檔。該案件因涉及蘇聯通商密約而引發外交干預，警隊專案組被迫解散后，Rath與猶太裔上司Bernard Benda秘密重啟調查。隨著對柏林東正教社區藏尸點的追蹤，發現死者攜帶的加密文件關聯德國軍工企業與蘇聯特工的政治交易。與此同時，Rath因調查納粹沖鋒隊非法集會遭政治部主管Voss施壓，被迫在追查卡爾達科夫案與平息內部權力斗爭間周旋。Charlotte憑借對城市地下勢力的熟悉突破調查瓶頸，其弟被卷入的政治暴力事件亦揭示警界高層與右翼組織的利益勾連。