藍(lán)海醫(yī)院院長(zhǎng)周霖在醫(yī)療改革試點(diǎn)單位的重壓下，因衛(wèi)生廳劉會(huì)計(jì)被謀殺及巨額回扣款失蹤事件陷入危機(jī)。其兩名得意門生——冷峻務(wù)實(shí)的李衛(wèi)國（外號(hào)“小李飛刀”）與理想主義改革派陸一鳴——因醫(yī)改路線產(chǎn)生激烈沖突。兩人在處理安樂死、艾滋病防治及江湖游醫(yī)等敏感案件時(shí)矛盾升級(jí)，情感糾葛更使局勢(shì)復(fù)雜化：周霖希望女兒、電視臺(tái)主持人周可馨能與陸一鳴結(jié)合，但周可馨傾心于李衛(wèi)國；實(shí)習(xí)醫(yī)生劉洋暗戀陸一鳴，醫(yī)療器械商人吳竟則周旋于兩位醫(yī)生之間。醫(yī)院接連遭遇紅包丑聞、毒大米事件及礦難救援等生死考驗(yàn)，下崗工人盲童救助、女大學(xué)生維權(quán)和血源性艾滋病感染等社會(huì)問題接連浮現(xiàn)。在醫(yī)患矛盾激化與陰謀漩渦中，周霖能否洗清冤屈？殺害劉會(huì)計(jì)的真兇身份與師徒三人如何突破困局的命運(yùn)走向，成為貫穿全劇的核心懸念。