從地球誕生之初，一種奇怪的生物便出現在這顆藍色星球上。他們不斷進化、蛻變，終于成為我們所熟悉的小黃人模樣。小黃人們畢生尋找邪惡的老大以成為其部屬為榮，但千百萬年的努力最終化作徒勞。經歷漫長沉寂后，名叫凱文的小黃人決定再度啟程，他帶著熱愛音樂的斯圖爾特、成事不足敗事有余的鮑勃，穿越海洋來到1968年的美國。三個小家伙偶然得知奧蘭多即將召開"惡人大會"，便匆忙趕往會場并陰差陽錯成為女魔頭斯嘉麗·殺人狂（桑德拉·布洛克配音）的隨從。受命竊取英國女王王冠的小黃人們興高采烈展開行動，卻不知自己成為斯嘉麗篡位計劃的工具。在倫敦塔執行任務時，他們意外發現斯嘉麗的真實陰謀——企圖用陷阱奪取王位。最終小黃人們幫助女王逃脫險境，延續了尋找邪惡主人的千年使命，而這段冒險經歷也成為了他們漫長進化史中又一段啼笑皆非的插曲。