警視廳搜查二課的警員們以追查消失的10億日圓為目標展開調查，發現這筆涉及外務省機密費詐取的巨款流向與被稱為"三惡人"的外務省核心官員存在關聯。隨著調查深入，專案組逐步揭開圍繞國家機密費的黑色利益鏈條，發現案件背后不僅牽扯外交系統內部盤根錯節的權力關系，更暴露出政界高層與財閥勢力相互勾結的犯罪網絡。在持續對抗過程中，辦案警察既要面對來自上層機構的施壓阻撓，又需突破關鍵證人的死亡威脅。最終通過交叉比對離岸賬戶資金流向與外交檔案，成功鎖定三名外務省高官在海外基建項目中偽造文書、虛報預算的犯罪證據。案件偵破過程中暴露出的系統性腐敗導致警界與外務省展開大規模內部整頓，但主要涉案官員因外交豁免權問題引發司法管轄爭議。