海綿寶寶與伙伴們發現皮老板因試圖重啟被毀壞的餐廳而誤入時空裂隙，意外喚醒了原為人工智能的凱倫。當得知變異失控的凱倫計劃通過吞噬時間能量征服海洋時，眾人決定協助自大卻無能的皮老板修復關系。在穿越多個時空場景的冒險中，海綿寶寶團隊用音樂盒、蟹黃堡配方等物品喚醒凱倫殘存的溫情記憶，最終在比奇堡決戰時刻以集體友誼的力量感化凱倫。失控的量子計算機恢復成最初形態后，皮老板與凱倫重啟系統時產生的能量波動使時空秩序回歸正常，所有被卷入事件的海洋生物安然無恙，海底世界重歸平靜。