李時(shí)珍（林文龍飾）自由沉迷于草藥研究之中，他同名為吳慕榕（李詩(shī)韻飾）的女子先前已有婚約，卻無(wú)法自持的愛(ài)上了善良美麗的阿冬（葉璇飾）。李時(shí)珍決定將這份感情埋藏在心底，待科舉考試之后向阿冬表白心意，哪知道在陰差陽(yáng)錯(cuò)之中，他不僅沒(méi)能夠表白，還娶了吳慕榕為妻。李時(shí)珍發(fā)現(xiàn)當(dāng)今世上的醫(yī)書(shū)錯(cuò)誤連連漏洞百出，于是起了編撰《本草綱目》的念頭。然而，他卻因?yàn)閭€(gè)性過(guò)于耿直而得罪了權(quán)貴，使得他不得不暫時(shí)中斷了醫(yī)書(shū)的編撰，還性命不保踏上了逃亡的旅途。所幸有太醫(yī)院的龐憲（馬國(guó)明飾）一路幫助扶持，李時(shí)珍終于完成了曠世奇作《本草綱目》。