兩個四年級學生喬治(凱文·哈特配音)和哈羅德(托馬斯·米德蒂奇配音)，通過催眠術將霸道校長(艾迪·赫爾姆斯配音)變成了內褲隊長。原本為了反抗校長的高壓管理，兩人意外創造出這位穿著紅色緊身衣和白色內褲、自詡正義卻行為荒誕的超級英雄。失控的"內褲隊長"將學校改造成奇幻游樂場，卻在對抗新反派"太空女巫"時暴露出能力缺陷。隨著混亂升級，兩位少年被迫直面自己制造的危機，在協助校長恢復理智的過程中學會承擔責任。影片通過荒誕設定探討了成長、友誼與規則的意義，最終以校長保留部分超能力卻不再濫用的開放式結局收尾。