公元2010年超級颶風引發全球性災難，世界人口從80億銳減至30億，地理格局劇變。日本通過建立經濟特區與"力量輔助"技術實現局部復興，但統治階級Logos將貧困階層Levinas視為排斥對象，并將軍用化的該技術用于階級統治。2035年，前特殊部隊"幻影"成員葛城丈與戰友鶴澤脫離組織，在逃亡途中偶遇神秘少女登戶沙那。隨著Logos對Levinas的鎮壓升級，三人被迫卷入階級戰爭的核心地帶。沙那體內潛藏的特殊基因信息成為雙方爭奪的關鍵，其真實身份關聯著"力量輔助"技術的起源與失控危機。丈為保護沙那而對抗昔日同僚，在階級對立、技術倫理與人性存亡的漩渦中，被迫直面自己參與構建的暴力系統。當沙那作為"維納斯計劃"核心載體的身份揭曉時，三人組的抉擇直接牽動著Logos與Levinas勢力平衡的最終走向。