在每一個角落都被探索完畢的世界中，唯一殘留的秘境——大洞穴“阿比斯”。不知道延續到何方，深不見底的巨大縱向洞穴棲息著奇妙奇怪的生物，沉眠著人類無法制造的貴重遺物。孤兒莉可為追尋母親萊薩的腳步，攜機器人雷格啟程探秘深淵。深界四層中莉可遭穿彈獸毒害，被生骸娜娜奇所救。三人結伴穿越險境抵達深界五層，在波多爾多棲息的永劫圖書館遭遇自稱普魯修卡的少女。其真實身份實為波多爾多之女，渴望獲得永不離開自己的同伴。五層秘境中暗藏吞噬生命的血肉之海與禁忌遺物，娜娜奇通過記錄生命流動的“生骸”特性揭開深淵法則。眾人直面波多爾多威脅時，莉可吹響白笛喚醒雷格的崩壞武裝力量，在普魯修卡犧牲自我與娜娜奇研究數據幫助下，成功突破深淵的吞噬陷阱并獲取通往更深層的核心線索。