《團子大家族第二季》延續第一季劇情,聚焦岡崎朋也與古河渚婚后生活。兩人克服家庭困境后結為連理,在親友幫助下收養了失去雙親的孤女小汐,共同經營面包店維持生計。渚因病體衰弱始終未能康復,在小汐逐漸適應新家庭后離世,留下朋也獨自撫養女兒。失去摯愛的朋也在古河秋生夫婦支持下艱難維系家庭,同時通過整理渚遺留的手工繪本逐漸走出陰霾。故事后段揭曉小汐實為神明世界中渚與朋也未來之女的投影,隨著家族羈絆獲得現世具象化資格,渚得以以人類形態重返人間與家人團聚。全作通過平凡日常展現親情救贖主題,以面包店為舞臺串聯起跨越世代的情感傳承。