杰克·鮑爾(基弗·薩瑟蘭飾)在第五季結尾遭中國秘密逮捕并被關押20個月,在嚴刑拷問中始終未透露任何情報。此時美國本土遭遇疑似伊斯蘭教派武裝組織的連環炸彈威脅,CTU調查鎖定恐怖分子阿薩德為主要嫌疑人。為實施刺殺計劃,美方與中方達成交易換回杰克作為誘餌。然而行動過程中,杰克發現恐怖襲擊的真實幕后主使實為偽裝成阿薩德的哈比卜,其陰謀通過核彈襲擊引發更大規模災難。在與CTU特工托拜厄斯(彼特·麥尼科飾)的合作因身份暴露而失敗后,杰克孤身潛入敵方據點展開營救行動,最終成功摧毀核裝置并擊斃哈比卜。期間杰克與女兒之間的誤會得以消除,但CTU總部遭導彈襲擊徹底損毀。