為追蹤4名血繼限界繼承者的下落，小櫻（中村千絵配音）、漩渦鳴人（竹內順子配音）、卡卡西（井上和彥配音）與佐井奉命前往巖隱和草隱交界的須彌山執行任務，卻在行動中失去目標并遭強敵伏擊。鳴人與佐井身受重傷之際，自稱卑留呼（保志総一朗配音）的前木葉叛忍現身宣戰——此人曾因研習禁術鬼芽羅術遭驅逐，現意圖通過集齊五個血繼限界移植至自身，達成制造不死完美忍者的野心，并以此挑起第四次忍界大戰。卡卡西因與卑留呼曾有的師徒羈絆而被對方刻意針對，陷入生死未卜的危機。面對失去重要導師與血繼限界遭掠奪的雙重困境，鳴人帶領團隊在木葉村及忍界各國聯合對抗中展開反擊，最終挫敗卑留呼借血繼限界顛覆忍者世界秩序的陰謀。