2131年地球經歷毀滅性大戰后，幸存者在廢墟上建立名為奧林帕斯的理想國。少女琉南·納茲與火力強大的人造人激戰時，被前男友布里亞留斯和特工瞳率領的精銳小隊救出。改造人形態的布里亞留斯曾因北非戰場重傷失去大部分軀體，如今與琉南重逢后共同進駐這座科技高度發達的城邦。在目睹人類與人造人共存的光鮮表象下，琉南逐漸察覺到異常：奧林帕斯由人工智能"赫爾墨斯"管理并實施基因分級制度，所謂理想國實則建立在對"純血統者"的篩選與控制之上。隨著瞳的真實身份曝光及神秘組織"克洛諾斯"的陰謀浮現，布里亞留斯帶領團隊深入中央數據庫，在揭露基因改造計劃真相的過程中與維護系統運轉的終極人造人展開對決。這場關乎人類存續方式的沖突，最終以琉南摧毀核心控制中樞、終結基因篩選體制而告終。