怪盜基德的預告信出現在北海道函館斧江財閥收藏庫，目標指向江戶幕府時期新選組副長土方歲三的日本刀。追逐奢華寶石慣常手法的基德反常舉動引發關注，柯南與服部平次因劍道大會同期抵達函館。基德執行計劃當日，服部平次識破其偽裝展開追擊，而函館倉庫街發現的胸口十字傷口尸體牽出美籍日裔軍火商"死之商人"——此人正搜尋斧江家初代藏匿的幕末戰爭武器寶藏。經調查，軍火商為奪取線索殺害斧江家關鍵成員，而傳說中的寶藏與土方歲三之刀存在關聯：該刀實為藏寶圖關鍵標記?；聜窝b劫案實則欲將刀帶離險境，服部平藏舊友后裔劍士與柯南團隊協力揭露真相。最終軍火商的犯罪動機被公之于眾，歷史遺產得以保全，五棱星形狀的百萬美元寶藏歸屬謎團隨案件告破塵埃落定。