櫻羽一時(shí)刻意回避著忍者存在的可能性，堅(jiān)信自己只是個(gè)普通高中生。直到甲賀忍族突然對(duì)他展開(kāi)獵殺，這個(gè)認(rèn)知被徹底顛覆——他竟是伊賀流派第十九代正統(tǒng)繼承人。為對(duì)抗甲賀的侵略陰謀，一時(shí)被迫踏入暗影中的忍者世界，在伊賀長(zhǎng)老指導(dǎo)下進(jìn)行嚴(yán)苛訓(xùn)練。隨著水遁術(shù)的覺(jué)醒與禁術(shù)卷軸爭(zhēng)奪戰(zhàn)的展開(kāi)，他逐漸發(fā)現(xiàn)甲賀首領(lǐng)竟是自己兒時(shí)救命恩人。在守護(hù)同伴與直面血脈宿命的抉擇中，伊賀與甲賀延續(xù)百年的血仇真相逐漸浮出水面。當(dāng)預(yù)言中的"雙月之災(zāi)"臨近，一時(shí)必須在兩族決戰(zhàn)前解開(kāi)先祖留下的「忍神碑」之謎，而他體內(nèi)沉睡的伊賀秘術(shù)最終覺(jué)醒時(shí)刻，將決定兩大忍族的命運(yùn)走向。