距今六千五百萬年前的遠古地球，亞格爾駕駛超時空飛船捕獲劍背龍、霸天龍、飛天龍和三角龍四只小恐龍進行腦容量進化實驗，企圖將其改造為征服宇宙的武器。被囚禁的恐龍因智力覺醒而反抗，在釋放后對亞格爾展開報復。空間警察珊娜率艦隊追蹤至地球時，與智慧恐龍產生交集并陷入亞格爾同黨黃鼠龍、烈焰龍和暴子龍的圍攻。激戰引發飛船爆炸，珊娜與四只恐龍共同進入救生艙逃生，最終墜入湖底陷入休眠。六千五百萬年后現代文明時代復蘇后，亞格爾遺留的超文明武器已導致恐龍滅絕，僅存的食草恐龍與企圖利用石油升溫地球的邪惡食肉龍展開對抗。隨著亞格爾通過微型耳機重現并收集能量，恐龍戰士們在北極、月球、氪星等多維度戰場挫敗其改造地球生態的陰謀，最終在智能星協助下將亞格爾及其追隨者徹底殲滅。星際恐龍與珊娜建立深厚羈絆，持續以正義力量守護地球免受各類跨時空威脅。
