神盾局淪陷后，寇森在尼克·弗瑞的授權下著手重建組織并修復與政府的信任關系。他帶領團隊在全球追捕九頭蛇殘余勢力，同時將叛徒沃德作為關鍵線索展開調查?？苌驈突钸^程中產生的副作用持續困擾——不可控的暴力傾向導致他刻劃神秘符號、甚至不惜犧牲隊員生命換取情報，多次將神盾局推向更危險的境地。另一方面，斯凱失散多年的父親卡爾文·扎博意外現身，其領導的異人族聯盟揭開了塵封千年的秘密。斯凱在得知自己作為異人的身份后陷入兩難抉擇：既渴望與血緣至親建立聯系，又不愿背叛并肩作戰的伙伴。隨著九頭蛇威脅與異人族危機的雙重壓迫，寇森團隊不得不在維護世界和平與堅守人性底線之間尋找平衡。