幼時曾深陷絕望深淵的直枝理樹與4位少年少女相遇，數年后作為LittleBusters成員過著喧鬧而快樂的生活。某日恭介提議組建棒球隊伍，理樹為此不斷尋找新成員的過程中邂逅了更多伙伴。團隊共同經歷試膽大會、潛入女生宿舍時被換裝女裝、合作演出人偶劇等趣事，在相互扶持中逐漸化解各自內心的煩惱。棒球比賽結束后，理樹與伙伴們確認了彼此間牢不可破的羈絆。然而故事并未就此結束，理樹與來谷唯湖之間的情感糾葛、鈴內心隱藏的傷痛往事逐漸浮現，理樹與鈴最終共同發現了"世界的秘密"。隨著真相的揭露，LittleBusters真正的物語由此揭開序幕——一個關于拯救、犧牲與命運抉擇的宏大篇章正式展開。