第三季延續第二季的故事脈絡，時間設定在第二季關鍵事件結束后的152年。銀河帝國因三王分裂陷入持續動蕩，基地在哈里·謝頓遺留的心理史學框架下持續推進科技傳播計劃。銀河系西北端的核能網絡逐步擴展，同時遭遇地方割據勢力與宗教組織的雙重阻力。關鍵歷史節點顯現，基地核心成員發現謝頓計劃中預設的重大轉折與現實走向產生偏差。帝國殘余勢力試圖通過聯姻重建正統性，而銀河大學舊址的考古發現意外揭示了謝頓未公開的數學模型。隨著星際航行技術的突破性進展，基地與外圍星系的力量平衡開始傾斜，心理史學預測的下一階段危機逐漸顯現。