解決掉「不凈冥王」的驅魔師私塾眾人從京都回到正十字學園后，遭遇「校園七大不可思議」與「學園祭」接連引發的異變。啟明結社暗中策劃以虛無界侵蝕人界的陰謀，借校園祭混亂拐走多名同學作為實驗對象。隨著同伴志摩廉造叛變并揭露啟明結社「通過虛無界之門重塑世界」的核心目的，奧村磷與雪男率領驅魔師團隊突破敵人設下的「幽世」結界，在解救被困者的同時與啟明結社首領展開對虛無界之門的爭奪戰。最終通過破壞結社核心裝置阻止了大規模虛無化現象，但志摩的背叛與啟明結社殘留勢力仍為正十字學園埋下隱患。