十年前，人類因猿流感病毒爆發陷入文明崩潰邊緣，猩猩首領凱撒（安迪·瑟金斯 飾）在舊金山叢林建立了以智慧猩猩為主的獨立族群。當幸存人類為解決能源危機試圖重啟森林腹地的水電站時，科學家馬爾科姆（杰森·克拉克 飾）主張與猩猩和平共處，而人類聚集地領袖德里弗斯（加里·奧德曼 飾）則持極端懷疑態度。猩猩陣營內部同樣暗流涌動，凱撒的摯友科巴（托比·凱貝爾 飾）因目睹同類遭受人類殘酷實驗而懷有深刻仇恨，他暗中挑動雙方矛盾并發動政變推翻凱撒。人類與猩猩的脆弱信任在連串沖突中徹底瓦解，雙方爆發全面戰爭。最終科巴奪取猩猩族群控制權后被凱撒擊殺，而馬爾科姆帶領的人類幸存者在猩猩族群年輕成員幫助下修復發電機，與凱撒建立新的互信關系。殘存人類撤離舊城時留下部分武器裝備，為后續人猿力量格局演變埋下伏筆。