這是一座地處大山深處、人口稀少的小村莊。村中的小學內,孩子們歡快的呼聲仿佛就在昨天,然而如今這里卻再也看不到一個小天使的身影。人口老齡化和過疏化讓村子變得老態龍鐘,暮氣沉沉。前校長(坂本長利飾)打理著早已關閉的舊校舍,就像對待自己的孩子般戀戀不舍,而校舍終將迎來拆除的命運。某天,曾在該小學長大的野田(西島秀俊飾)回到村中,如今他是某博物館館員,因為學校內出土了繩文時期的文物而被派來做清查。此外,他還希望能夠找到當初親手埋下的時間膠囊。隨著調查深入,野田發現二十年前孩子們集體失蹤事件與當地"哈梅爾的笛子"傳說存在關聯——當年前校長為阻止政府強制遷村,假借民間故事制造了孩童被魔笛帶走的幻象。當野田最終在地下室發現所有失蹤者留下的真實蹤跡時,前校長選擇以生命守護這個維系村莊精神的謊言。