加州海岸的深海中沉睡著兩只史前巨獸——噬人鯊與大烏賊，它們為爭奪海洋霸主地位已持續搏殺數百年。冰河時期將這場曠世對決凍結，直到近年全球氣溫上升喚醒了這兩頭龐然巨物。復活后的噬人鯊與大烏賊延續著宿命對決，它們的撕殺波及人類海域，巨型漩渦吞噬漁船，鋒利觸手擊穿鉆井平臺。為遏制災難蔓延，海洋生物學家與軍方組成聯合行動組，通過聲吶追蹤鎖定目標。科學家發現二者均攜帶遠古病毒，最終決定冒險使用深海核裝置實施定點爆破。在驚濤駭浪的決戰時刻，噬人鯊咬穿大烏賊的鰓部將其重創，核爆沖擊波則將瀕死的大烏賊徹底摧毀。當海面歸于平靜，噬人鯊拖著殘破身軀潛入深淵，人類雖暫時化解危機，但深海中仍回蕩著遠古巨獸的低頻嘶鳴。